Pendekatan pemahaman pengetahuan dan pengembangan keahlian siswa dengan cara "mengamati, mencoba, memahami, menganalisa, menemukan dan mencipta"  (6M)  untuk memecahkan masalah dalam kehidupan sehari-hari

Kegiatan SAINS ini dilaksanakan secara berkesinambungan diantaranya :

1.       School Sain Center

Pusat belajar Sains yang dimiliki Sekolah Pembangunan Jaya 2 didalamnya terdapat media belajar yang dibutuhkan siswa.

2.       Sains Night

Kegiatan mengamati dunia astronomi salah satunya dengan peneropongan bintang dan bulan.

3.       Lomba Alat Peraga

Kegiatan untuk meningkatkan kreatifitas siswa dalam berinovasi dan membuat alat peraga yang dilaksanakan disetiap unit Sekolah Pembangunan Jaya 2

4.       Pemilihan Duta Sains

Pemilihan siswa terbaik dalam bidang Sains dimana siswa yang terpilih akan menjadi duta dan nantinya akan diberikan pelatihan yang bersifat sains.